指導(dǎo)（）組織指導(dǎo)水利基礎(chǔ)設(shè)施網(wǎng)絡(luò)建設(shè)。指導(dǎo)重要江河湖泊及河口的治理、開發(fā)和保護。指導(dǎo)河湖水生態(tài)保護與修復(fù)、河湖生態(tài)流量水量管理以及河湖水系連通工作。

監(jiān)督司

三峽工程管理司

承辦部行政應(yīng)訴、行政復(fù)議和行政賠償工作。組織指導(dǎo)水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法，（）水事糾紛，組織查處重大涉水違法事件。

承擔(dān)實施最嚴(yán)格水資源管理制度相關(guān)工作，組織實施（）、水資源論證等制度，指導(dǎo)開展水資源有償使用工作。

負(fù)責(zé)水文水資源監(jiān)測、國家水文站網(wǎng)建設(shè)和管理。對江河湖庫和地下水實施監(jiān)測，發(fā)布水文水資源信息、情報預(yù)報和國家水資源公報。按規(guī)定組織（）、（）和水資源承載能力監(jiān)測預(yù)警工作。

國際合作與科技司

指導(dǎo)水量分配工作并監(jiān)督實施，指導(dǎo)（）。組織編制水資源保護規(guī)劃，指導(dǎo)（）。組織開展水資源調(diào)查、評價有關(guān)工作，組織編制并發(fā)布國家水資源公報。參與編制水功能區(qū)劃和指導(dǎo)入河排污口設(shè)置管理工作。

水庫移民司

水文司