擬訂水利工程移民有關(guān)政策并監(jiān)督實(shí)施，組織實(shí)施水利工程（）、（）等制度。指導(dǎo)監(jiān)督水庫移民后期扶持政策的實(shí)施，協(xié)調(diào)監(jiān)督三峽工程、南水北調(diào)工程移民后期扶持工作，協(xié)調(diào)推動(dòng)對(duì)口支援等工作。

指導(dǎo)水利工程建設(shè)管理，制定有關(guān)制度并組織實(shí)施。組織指導(dǎo)水利工程蓄水安全鑒定和驗(yàn)收，指導(dǎo)（）。指導(dǎo)水利建設(shè)市場(chǎng)的監(jiān)督管理和水利建設(shè)市場(chǎng)信用體系建設(shè)。

南水北調(diào)工程管理司

水庫移民司

組織實(shí)施具有控制性的和跨區(qū)域跨流域的重要水利工程建設(shè)與運(yùn)行管理。組織提出并協(xié)調(diào)落實(shí)（）和的有關(guān)政策措施，指導(dǎo)監(jiān)督工程安全運(yùn)行，組織工程驗(yàn)收有關(guān)工作，督促指導(dǎo)地方配套工程建設(shè)。

指導(dǎo)水利設(shè)施的管理、保護(hù)和綜合利用，組織編制水庫運(yùn)行調(diào)度規(guī)程，指導(dǎo)（）、水閘等水利工程的運(yùn)行管理與劃界。

水土保持司

水文司

河湖管理司

堅(jiān)持保護(hù)優(yōu)先，加強(qiáng)（）的管理保護(hù)，維護(hù)河湖健康美麗。堅(jiān)持統(tǒng)籌兼顧，保障合理用水需求和水資源的可持續(xù)利用，為經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展提供水安全保障。