問答題

【簡答題】什么是序列比對中使用的PAM矩陣和BLOSUM矩陣,它們的作用是什么,一般BLAST選擇使用的矩陣是什么

答案: PAM矩陣和BLOSUM矩陣都是用于序列相似性的記分矩陣(scoring matrix)。記分矩陣中含有對齊時具體使用的...
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【簡答題】BLAST中,E值和P值分別是什么,它們有什么意義?

答案: BLAST中使用的統(tǒng)計值有概率p值和期望e值。
E期望值(E-value)這個數(shù)值表示你僅僅因為隨機(jī)性造成獲得...
問答題

【簡答題】假設(shè)你得到一段未知蛋白的氨基酸序列,從你學(xué)習(xí)到的生物信息學(xué)分析方法和軟件,設(shè)計一個分析流程來分析該未知蛋白的功能和家族類別以及其結(jié)構(gòu)預(yù)測。

答案: 1、用該序列進(jìn)行BLASTP搜索。
2、再對其進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域、功能域的搜索,可以用Znterproscan、...
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