一些能夠結(jié)構(gòu)核小體覆蓋的DNA,一些不能。例如,TFIIIA不能結(jié)合核小體覆蓋的DNA而糖皮質(zhì)激素受體則可以。
同源框蛋白和亮氨酸拉鏈轉(zhuǎn)錄因子通過位于大溝中的α-螺旋與DNA結(jié)合。
亮氨酸拉鏈轉(zhuǎn)錄因子識別沒有間隔的反向重復(fù)序列。亮氨酸拉鏈區(qū)將兩個亞基連接在一起,使相鄰的堿性區(qū)域以相反的極性首尾相連。