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問(wèn)答題blast用什么樣的思想和方法提高了序列搜索的效率？

參考答案： Blast是通過(guò)比對(duì)（alignment）在數(shù)據(jù)庫(kù)中尋找和你的查詢序列（query）相似度很高的序列，通俗地說(shuō)就是在已知...

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1.問(wèn)答題什么是全局比對(duì)、局部比對(duì)？如何通過(guò)動(dòng)態(tài)規(guī)劃算法，填寫動(dòng)態(tài)規(guī)劃矩陣，分別對(duì)兩條序列進(jìn)行全局比對(duì)和局部比對(duì)？

參考答案：1.全局比對(duì)算法，也叫Needleman和Wunsch算法。全局比對(duì)方法中，兩條蛋白質(zhì)序列具有最多匹配殘基定義為最佳匹配...

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2.問(wèn)答題什么是點(diǎn)陣圖（dot matrix）？作用與優(yōu)點(diǎn)。

參考答案：點(diǎn)陣圖分析（Dot matrix analysis）：是雙序列比對(duì)的基本方法，通常用圖示方法表示，非...

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3.問(wèn)答題什么是同源性（homology）、直系同源（ortholog）和旁系同源（paralog）？舉例說(shuō)明它們的關(guān)系？

參考答案：1.如果兩條序列有一個(gè)共同的進(jìn)化祖先，那么它們具有同源性（homology）。
2.同源性中存在兩個(gè)子類。當(dāng)同...

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4.問(wèn)答題什么是序列比對(duì)，雙序列比對(duì)，多序列比對(duì)？

參考答案：序列比對(duì)：又叫序列聯(lián)配，其意義在于從核酸、氨基酸的層次分析序列的相似性，推測(cè)其結(jié)構(gòu)功能及進(jìn)化上的聯(lián)系，是基因識(shí)別、分子進(jìn)...

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5.問(wèn)答題世界上三大核酸數(shù)據(jù)庫(kù)分別叫什么，由什么機(jī)構(gòu)進(jìn)行維護(hù)，兩個(gè)重要的蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)分別是什么，蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)是什么，他們分別由什么機(jī)構(gòu)進(jìn)行維護(hù)？

參考答案：1.美國(guó)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)GenBank從1979年開(kāi)始建設(shè)，1982年正式運(yùn)行（NCBI）；歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室的EMBL數(shù)據(jù)...

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