在離子色譜分析中，若水負峰的保留時間與待測離子的保留時間相同或接近時，就會產(chǎn)生干擾。

采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣顆粒物中水溶性陰離子時，顆粒物濾膜全程序空白試樣的制備是使用與樣品采集同批次的空白濾膜，按照與顆粒物濾膜試樣的制備相同步驟制備。

《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）樣品運輸和保存規(guī)定，采集的樣品于0℃~4℃冷藏、密封可保存30天。

《水質(zhì) 磷酸鹽的測定 離子色譜法》（HJ 669-2013）適用于地表水、地下水和降水中總磷酸鹽的測定。

《環(huán)境空氣和廢氣 氯化氫的測定 離子色譜法》（HJ 549-2016）測定的氯化氫指以氣態(tài)或霧滴形式存在的氯化氫氣體。

離子色譜的電導檢測器內(nèi)，電極間的距離G越小，死體積越小，則靈敏度越低。

采用《環(huán)境空氣 顆粒物中水溶性陰離子（F-、Cl-、Br-、NO-2、NO-3、PO3-4、SO2-3、SO2-4）的測定 離子色譜法》（HJ 799-2016）測定環(huán)境空氣降塵中的水溶性陰離子時，為了防止樣品變質(zhì)或冰凍，須在集塵缸內(nèi)加入硫酸銅、防凍液等。

為避免色譜柱容量的超載，在分析未知濃度的樣品時，最好先稀釋100倍進樣，或用微量進樣器進樣1-2ul，再根據(jù)所得結(jié)果選擇合適的稀釋倍數(shù)或進樣量，這樣既可以避免色譜柱容量超載，又可以減少強保留組分對柱子的污染。

采用離子色譜法測定水中磷酸鹽，樣品清潔，不存在重金屬、有機物等干擾的水樣，經(jīng)現(xiàn)場過濾后，可直接進樣。

采用《固定污染源廢氣 硫酸霧的測定 離子色譜法》（HJ 544-2016）測定固定污染源廢氣中的硫酸霧時，采樣使用的石英纖維濾筒無需前處理。