指導水利工程建設管理，制定有關制度并組織實施。組織指導水利工程蓄水安全鑒定和驗收，指導（）。指導水利建設市場的監(jiān)督管理和水利建設市場信用體系建設。

承擔機關和直屬單位的（）工作，指導水利行業(yè)人才隊伍建設。承擔水利體制改革的有關工作。

擬訂水土保持規(guī)劃并監(jiān)督實施，組織實施水土流失的（）并定期公告。負責建設項目水土保持監(jiān)督管理工作，指導國家重點水土保持建設項目的實施。

農(nóng)村水利水電司

組織開展大中型灌排工程建設與改造。指導農(nóng)村飲水安全工程建設管理工作，指導（）有關工作。（）工作。指導農(nóng)村水利改革創(chuàng)新和社會化服務體系建設。指導農(nóng)村水能資源開發(fā)、小水電改造和水電農(nóng)村電氣化工作。

水庫移民司

承辦部行政應訴、行政復議和行政賠償工作。組織指導水政監(jiān)察和水行政執(zhí)法，（）水事糾紛，組織查處重大涉水違法事件。

負責機關日常運轉工作，承擔信息、安全、保密、信訪、（）等工作。

擬訂水利戰(zhàn)略規(guī)劃，組織編制重大水利（），審核重大水利建設項目建議書、可行性研究報告和初步設計。

擬訂水利工程移民有關政策并監(jiān)督實施，組織實施水利工程（）、（）等制度。指導監(jiān)督水庫移民后期扶持政策的實施，協(xié)調(diào)監(jiān)督三峽工程、南水北調(diào)工程移民后期扶持工作，協(xié)調(diào)推動對口支援等工作。